Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc190Q3URK1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc190Q3URK1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms