Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms