Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep63Q3UPP8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep63Q3UPP8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms