Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Tmem253Q3UNB8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Tmem253Q3UNB8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem253Q3UNB8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Tmem253Q3UNB8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Tmem253Q3UNB8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Tmem253Q3UNB8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tmem253Q3UNB8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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