Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Upf3aQ3ULJ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3aQ3ULJ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3aQ3ULJ3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms