Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spg7Q3ULF4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spg7Q3ULF4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spg7Q3ULF4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spg7Q3ULF4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spg7Q3ULF4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spg7Q3ULF4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spg7Q3ULF4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spg7Q3ULF4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spg7Q3ULF4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Spg7Q3ULF4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms