Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BtrcQ3ULA2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BtrcQ3ULA2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BtrcQ3ULA2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BtrcQ3ULA2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BtrcQ3ULA2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BtrcQ3ULA2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BtrcQ3ULA2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BtrcQ3ULA2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BtrcQ3ULA2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BtrcQ3ULA2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BtrcQ3ULA2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms