Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sf3b2Q3UJB0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sf3b2Q3UJB0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms