Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccser2Q3UHI0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms