Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx27Q3UHD6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx27Q3UHD6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms