Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3aQ3UFY4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph3aQ3UFY4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms