Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Parp8Q3UD82 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms