Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem109Q3UBX0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem109Q3UBX0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms