Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pid1Q3UBG2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pid1Q3UBG2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms