Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3U6N9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U6N9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U6N9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3U6N9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U6N9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U6N9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3U6N9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3U6N9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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