Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssbp4Q3U4B1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssbp4Q3U4B1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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