Protein–RNA interactions for Protein: Q3U492

Kcp, Kielin/chordin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KcpQ3U492 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KcpQ3U492 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KcpQ3U492 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KcpQ3U492 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms