Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otud5Q3U2S4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud5Q3U2S4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud5Q3U2S4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud5Q3U2S4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud5Q3U2S4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud5Q3U2S4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud5Q3U2S4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms