Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm4dQ3U2K5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kdm4dQ3U2K5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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