Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem35bQ3U0Y2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms