Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hace1Q3U0D9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hace1Q3U0D9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms