Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd1Q3TXS7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd1Q3TXS7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmd1Q3TXS7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms