Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ccdc136Q3TVA9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc136Q3TVA9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc136Q3TVA9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc136Q3TVA9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc136Q3TVA9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms