Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTH7

1500011B03Rik, RIKEN cDNA 1500011B03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500011B03RikQ3TTH7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1500011B03RikQ3TTH7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.05■□□□□ 0
1500011B03RikQ3TTH7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1500011B03RikQ3TTH7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
1500011B03RikQ3TTH7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
1500011B03RikQ3TTH7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1500011B03RikQ3TTH7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms