Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XylbQ3TNA1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms