Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp4cQ3TKR3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms