Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afvQ3THW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms