Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 556.3 ms