Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M3Q31093 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms