Protein–RNA interactions for Protein: Q30KP4

Gm17416, Beta-defensin (Fragment), mousemouse

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Length 66 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17416Q30KP4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm17416Q30KP4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm17416Q30KP4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm17416Q30KP4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm17416Q30KP4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17416Q30KP4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17416Q30KP4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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