Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms