Protein–RNA interactions for Protein: Q2VLH6

Cd163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, mousemouse

Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd163Q2VLH6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd163Q2VLH6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd163Q2VLH6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd163Q2VLH6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms