Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
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Shroom4Q1W617 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
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Shroom4Q1W617 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
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Shroom4Q1W617 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Shroom4Q1W617 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Shroom4Q1W617 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Shroom4Q1W617 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Shroom4Q1W617 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Shroom4Q1W617 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
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Shroom4Q1W617 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
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Shroom4Q1W617 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Shroom4Q1W617 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
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Shroom4Q1W617 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Shroom4Q1W617 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Shroom4Q1W617 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
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Shroom4Q1W617 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Shroom4Q1W617 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Shroom4Q1W617 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
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Shroom4Q1W617 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Shroom4Q1W617 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Shroom4Q1W617 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
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Shroom4Q1W617 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
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Shroom4Q1W617 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Shroom4Q1W617 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Shroom4Q1W617 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Shroom4Q1W617 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
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Shroom4Q1W617 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
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Shroom4Q1W617 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
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Shroom4Q1W617 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Shroom4Q1W617 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Shroom4Q1W617 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
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Shroom4Q1W617 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
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Shroom4Q1W617 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
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Shroom4Q1W617 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom4Q1W617 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom4Q1W617 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
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Shroom4Q1W617 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Shroom4Q1W617 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Shroom4Q1W617 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Shroom4Q1W617 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Shroom4Q1W617 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Shroom4Q1W617 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Shroom4Q1W617 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Shroom4Q1W617 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Shroom4Q1W617 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Shroom4Q1W617 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Shroom4Q1W617 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Shroom4Q1W617 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Shroom4Q1W617 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Shroom4Q1W617 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Shroom4Q1W617 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
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