Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim71Q1PSW8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms