Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo3bQ1EG27 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo3bQ1EG27 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo3bQ1EG27 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo3bQ1EG27 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo3bQ1EG27 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo3bQ1EG27 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo3bQ1EG27 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Myo3bQ1EG27 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myo3bQ1EG27 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms