Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tdrd9Q14BI7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tdrd9Q14BI7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tdrd9Q14BI7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tdrd9Q14BI7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tdrd9Q14BI7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tdrd9Q14BI7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tdrd9Q14BI7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tdrd9Q14BI7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Tdrd9Q14BI7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tdrd9Q14BI7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Tdrd9Q14BI7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
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Tdrd9Q14BI7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Tdrd9Q14BI7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tdrd9Q14BI7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms