Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Gli2Q0VGT2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Gli2Q0VGT2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms