Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc39dQ0VF76 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc39dQ0VF76 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms