Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col19a1Q0VF58 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col19a1Q0VF58 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col19a1Q0VF58 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms