Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hif3aQ0VBL6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hif3aQ0VBL6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms