Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5cQ0V8T7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5cQ0V8T7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5cQ0V8T7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms