Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lrriq1Q0P5X1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lrriq1Q0P5X1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Lrriq1Q0P5X1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms