Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Vps8Q0P5W1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Vps8Q0P5W1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Vps8Q0P5W1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Vps8Q0P5W1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms