Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SobpQ0P5V2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SobpQ0P5V2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SobpQ0P5V2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SobpQ0P5V2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms