Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn2Q08093 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cnn2Q08093 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnn2Q08093 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms