Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F13bQ07968 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F13bQ07968 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F13bQ07968 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13bQ07968 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F13bQ07968 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F13bQ07968 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms