Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ebf1Q07802 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms