Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrstQ06666 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrstQ06666 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrstQ06666 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms