Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc2Q05020 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms