Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nf1Q04690 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nf1Q04690 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms